在农学研究方面，农学部的农业会计研究设施在农业会计学和农家经济分析学方面为日本唯一的研究与教育普及部门；植物生殖设施在植物的起源、分化、传播、远缘杂交、遗传资源的收集保存等方面显示出该资源的优势，被国际遗传资源理事会认定为“基本银行”而成了国际活动中心。
从日本最高学术奖学士院奖的获奖情况更可直接看出京都大学的实力和地位。1911-1990年的80年间，京都大学出身的人共有71人获奖，占全日本获奖人数的12.4%。从学科上分析，经济学与东京大学不相上下，并列第一；12个学科中有7个处于全国大学中的第2位，3个学科第3位，只有法学、政治学未能进入前3名。再从现今在京大工作的获奖者情况比较，结果与上面差不多，除了法学、政治学外，其余11个学科均进入前3名，其中数学为第1位，7个学科第2位，3个学科第3位，综合以上两方面的分析，可明显看出京大在全国大学中均已稳坐第二的交椅。